У вас считали 2 ошибки - выходного вала и датчика положения дроссельной заслонки. Вот их и необходимо устранить.
ДПДЗ вообще легко проверяется тестером. Качайте мануал, там подробно описано как.
Датчик выходного вала или поменять или найти электрика (лучше гаражного какого нибудь) и пусть он проверит. Я бы осциллографом посмотрел. Ну и неплохо бы просто залезть под авто и осмотреть там провода - может они на соплях болтаются

Еще: Zilla спросил - если ездить без четвертой передачи (выключить кнопкой OD) проблема возникает? В зависимости от ответа на данный вопрос можно дальше думать что делать. Этот момент необходимо проверить и он прояснит ситуацию.
В момент когда вы тормозите, и после начинаются проблемы, в салоне что-нибудь щелкает где-нибудь под панелями? Может лампочки притухают или еще что-то необычное происходит? А если по кочкам поскакать не слабо так проблема проявится?